Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms