Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms