Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms