Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms