Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD1Q6UXZ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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