Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms