Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF880Q6PDB4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms