Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP5Q6NZY7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP5Q6NZY7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms