Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAAP20Q6NZ36 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms