Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms