Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms