Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN10Q6JVE6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms