Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYOM3Q5VTT5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms