Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms