Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms