Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms