Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3KQ59H18 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms