Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSP90AB3PQ58FF7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB3PQ58FF7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms