Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms