Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms