Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms