Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms