Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms