Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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GEN1Q17RS7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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