Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms