Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms