Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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