Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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