Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITSN1Q15811 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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