Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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