Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUM3Q15397 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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