Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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