Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CLCA4Q14CN2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLCA4Q14CN2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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