Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP1BQ14684 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP1BQ14684 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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