Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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