Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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