Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP1Q13835 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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