Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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