Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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