Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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