Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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