Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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