Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms