Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAD4Q13485 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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