Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SCGB2A2Q13296 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SCGB2A2Q13296 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SCGB2A2Q13296 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCGB2A2Q13296 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCGB2A2Q13296 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SCGB2A2Q13296 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCGB2A2Q13296 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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