Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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NME3Q13232 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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