Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2BQ13224 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
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