Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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