Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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