Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NFS1-207ENST00000421540 563 ntTSL 519.62■□□□□ 0.734e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 NFYC-224ENST00000534399 574 ntTSL 418.5■□□□□ 0.554e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.374e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 NFS1-206ENST00000419569 551 ntTSL 316.42■□□□□ 0.224e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.184e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.064e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.044e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 SFI1-226ENST00000491973 580 ntTSL 414.75□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.084e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 213.58□□□□□ -0.244e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.384e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 FAM171A1-203ENST00000477161 617 ntTSL 312.59□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.054e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.294e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 RBPMS-216ENST00000522694 613 ntTSL 23.64□□□□□ -1.834e-7■■□□□ 13.7
ILF3Q12906 AGFG1-207ENST00000458212 815 ntTSL 23.28□□□□□ -1.884e-7■■□□□ 13.7
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ILF3Q12906 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.87e-7■■□□□ 13.6
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ILF3Q12906 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.977e-7■■□□□ 13.6
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ILF3Q12906 CDC45-206ENST00000438587 552 ntTSL 46.86□□□□□ -1.316e-7■■□□□ 13.6
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ILF3Q12906 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.344e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.324e-7■■□□□ 13.6
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ILF3Q12906 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-7■■□□□ 13.6
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ILF3Q12906 CERCAM-207ENST00000463535 1205 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERCAM-205ENST00000420512 887 ntTSL 313.78□□□□□ -0.24e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.434e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERCAM-211ENST00000487001 553 ntTSL 511.19□□□□□ -0.624e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERCAM-210ENST00000483893 587 ntTSL 49.24□□□□□ -0.934e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNFT2-206ENST00000551251 739 ntTSL 38.14□□□□□ -1.114e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.694e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.854e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-206ENST00000447406 1146 ntTSL 518.59■□□□□ 0.571e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-210ENST00000492703 726 ntTSL 517.35■□□□□ 0.371e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-205ENST00000438549 631 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.291e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-208ENST00000473615 2075 ntTSL 211.38□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-209ENST00000480153 2447 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.71e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 DSN1-202ENST00000373740 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SNTB2-203ENST00000467311 1489 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.073e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SNTB2-202ENST00000360496 415 ntTSL 214.97□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SNTB2-204ENST00000524887 537 ntTSL 314.84□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SNTB2-205ENST00000525632 536 ntTSL 314.84□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 UTP4-210ENST00000567287 366 ntTSL 37.4□□□□□ -1.223e-6■■□□□ 13.6
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